可以尝试使用D3Dwindower。
使用方法:使用该工具开启仙剑三，即为窗口模式，正常开启仙剑三仍为全屏模式，不会受到影响。
1.解压后运行D3DWindower。
2.按菜单中的"+'选择仙剑三游戏执行档PAL3.exe。(就是写着仙剑的那个图标)
3.左键单击下方的PAL3图标，右键选择设置，弹出设置对话框。
4.点击右下角的"打开"按钮，选择软件的安装目录里的D3dHook.dll。?(注意是软件目录，不是游戏目录)?
5.选择上方"输入设备"标签，钩选"钩住directinput"，在"鼠标位置修正"中，钩选"转换setcursorpos"和"转换getcursorpos"。
6.关闭设置对话框，左键单击下方的PAL3图标，右键选择运行，开启游戏。（不要正常运行游戏）
经本人测试，仙剑3及其外传均可正常使用。但是！！！如果你打了游侠网的免cd补丁，则该方法失效~~~LZ可以一试。为防止百度屏蔽，为下载地址~~
仙剑三窗口化工具-3DAnalyze
解压文件，注意：不要将文件夹放在仙剑3游戏目录下，否则后面会报错。
2.按Select，在游戏文件夹中选定执行档PAL3.exe
3.如下设置
i)
钩选Performance列的force
windowed
mode选项
ii)
钩选Hardware
Limits列的emulate
DXT
textures选项
4.点击RUN键即可开启游戏（不要正常运行游戏）
仙剑三已经解窗口化问题。我给你个链接你去下载吧。这样就能一边玩一过看攻略了。呵呵。
我用的是仙剑联盟上推荐的窗口化软件，非常好用，正版与下载版同样适用。
使用方法：
这个补丁原来是用在冒险岛上的，可以用在窗口化仙三及外传上。（仙剑客栈经过试验，没办法）
方法：
解压文件，运行“窗口化.exe”文件。点击菜单操作——选择添加。在路径中选择仙三/外传的执行文件。并选择中以下几项：
需要挂钩的DirectX版本：
DirectX9
任务变化时不提示
自动修正鼠标位置
★★★注意：
窗口化后，不可以点击最小化，也不要点击“显示桌面”，不然仙三依然会跳出。原窗口大小的时候比较容易点到最小化按钮上。但将窗口最大化后，鼠标是移不上去的，可以尽情地玩，在此推荐最大化窗口。游戏中ALT+TAB可以切换。
经过试验，新仙剑也可以窗口化
方法是把选项里的DirectX版本选择为DirectX-DirectX6
不过，新仙剑窗口化后，不能像仙三和问情篇一样将窗口最大化。
而且如果有移动过游戏窗口，在播放动画的时候，窗口又会返回左上角
仙二暂时试验失败
注意：
如果游戏运行后没有鼠标，要点游戏安装目录里的config程序，把“软件光标”项选中就可以了.
在玩各种全屏运行的游戏的时候，笔者一直希望能有一种办法将游戏窗口化运行，而不是只能全屏运行它。这样在玩游戏的时候可以方便使用QQ等软件与网友联系，近日，笔者发现了这款软件： D3Dwindower ，它可以很容易的将一些只能全屏的游戏窗口化。
D3DWindower的主界面如下图 图1 所示：
图1： D3Dwindower v1.88 汉化版的主界面
下面以仙剑奇侠传3为例来分步介绍该软件的用法：
第一步：添加要运行游戏的可执行程序
在该软件的主界面上点击按钮来添加希望使用该工具窗口 化运行的程序，在弹出对话框中选择游戏仙剑奇侠传3的可执行程序。如下图2所示：
图2：选中仙剑奇侠传3可执行程序
在选择好仙剑奇侠传3的可执行程序之后，回到 D3DWindower 的主界面，发现在 D3DWindower 的主界面的列表上面就出现了仙剑奇侠传3的可执行程序，如下图3所示：
图3：仙剑奇侠传3的可执行程序已经添加到了 D3DWindower 的列表上了
第二步：让D3DWindower钩住游戏的可执行程序
D3DWindower的原理是构建一个虚拟的显示器，让游戏运行在这个显示器中，当然，在让全屏游戏在D3DWindower中运行前，必须先让它认识并熟悉该游戏。这儿叫做“钩住”游戏。使用 D3DWindower 的钩子函数 钩住仙剑奇侠传3的可执行程序的方法如下：（其他游戏相同）
首先在D3DWindower的列表中选 中仙剑奇侠传3的可执行程序，然后点击按钮，工具栏上面的图标就变成如下图4所示：
图4：看到工具栏变成这个样子，就说明仙剑奇侠传3的可执行程序被钩住了
第三步：运行仙剑奇侠传3的可执行程序
选中D3DWindower列表中的仙剑奇侠传3的可执行程序，然后点击工具栏上面的按钮就可以在窗口中执行仙剑奇侠传3了。如下图图5所示的就是笔者在窗口方式下执行的仙剑奇侠传3。
注意:若发现游戏过程中鼠标输入有一些问题的话,请参考附录中的第4部分
图5：窗口方式下的仙剑奇侠传3，大家觉得怎么样？
附：D3D其他功能介绍
其实，这款软件的功能不仅仅是上文中所介绍的。在选中列表中的可执行程序后还可以通过点击工具栏上面的按钮 对运行仙剑奇侠传3的那个窗口进行更高级的设置。在“设置”对话框中，它分为了四个子界面：“一般”设置界面，“窗口化”设置界面，“最上方管理”设置界面和“输入设备”设置界面。
(1).“一般”设置界面
如下图6所示：
图6：“一般”设置界面
在该界面中可以设置该窗口是否***用固定的宽度和高度（填入的数字代表像素数，如800*600），这样，窗口的大小就不会随着游戏的分辨率的改变而改变了，将“固定宽度”和“固定高度”设置成 0 便可以设置不使用固定的窗口大小了。
“窗口化”复选框可以用来设置在 D3DWindower 中运行游戏是使用全屏还是窗口。
“显示 FPS ”复选框可以用来设置在窗口方式下运行游戏时是否显示当前每秒的帧数。
“非活动时降低优先级”复选框可以让游戏在没有处于活动状态下是否降低它的优先级。
“非活动时缩小窗口”复选框可以让游戏在没有处于活动状态下自动减小它的窗口，从而不会干扰的其他操作。
(2).“窗口化”设置界面
如下图7所示:
图7：“窗口化”设置界面
此界面用来设置游戏画面的显示，如果大家对游戏显示出来的画面不满意，可以在这里进行详细设置。
(3).“最上方管理”设置界面
如下图8所示：
图8：“最上方管理”设置界面
在该界面中，可以设置是否将游戏窗口置于桌面的最前方，这样就算在干其他工作，也不会影响看到游戏的整个概貌了。
如果选择了“最上方管理”复选框，可以选择最上方管理的高级设置：是否“钩住 GetActiveWindow”函数，是否“钩住GetForegroundWindow”函数以及是否“固定窗口坐标”。
（4）.“输入设备”设置的界面
如下图9所示：
图9：“输入设备”设置的界面
如果大家发现在一些游戏中的鼠标输入有一些问题的话，就可以在这个界面上进行设置了。 笔者在玩仙剑奇侠传3时就发现鼠标点击位置不正确，通过把此界面的复选框全部选中而解决了问题
你去下个D3Dwindower游戏窗口化工具（即directx游戏窗口化工具),我用的是v1.88中文版的。打开软件后选择“+”那个按钮，然后打开仙3的运行程序，选中后再选择第六个按钮（一共有七个），有点像文件夹的那个，叫做“更改选中程序的设置”。首先在“一般”选项中“窗口化前面打勾”；***DLL中打开窗口化工具的文件夹，选择里面的叫“D3DHOOK.dll”；然后在“窗口化"选项中，上面一排“钩住****”三个都打勾，下面的打勾与否影响应该不大；最后在“输入设备”选项中，“钩住directinput"前打勾，后面的随意，按确定就可以了，双击里面的仙3的运行程序或者选择三角的那个按钮就能运行了。按alt + tab可以将鼠标从画面中切换出来。你也可以网上看看这个工具的教程，还是比较简单的。以后每次游戏都要从这个工具里面进。
这是一个下载地址： id="id5">仙剑奇侠传三窗口化工具怎么用
仙3窗口化工具(同时也适用于外传 修改成pal3a.exe即可）原程序来自仙盟
解压后运行窗口化.exe 可以看到F:\PAL3\PAL3.exe 在这个上面点右键-修改-路径改成你电脑中的仙3目录下的pal3.exe 或是直接链接到桌面的仙3快捷方式 点确定 然后双击运行即可
如果出现游戏中无鼠标的现象 请运行游戏目录下的config.exe 勾选软件光标然后点确定
这是专门使仙剑3和仙剑3外传窗口化的工具很方便，绝对可以窗口化，你可以试试
我用的是D3DWindower，应该就是这个，
你先解压，后会有一个对话框，你选择“+”按钮后
找到你要运行的快捷方式后，双击，
快捷方式就会出现在下面的白框框中，
然后你选中下面你要运行的快捷方式（注意是单击），
上面的就会有三个按钮变亮，找到从右边数第二个按钮，单击它，
又会出现一个对话框，在一般栏中找到***DLL，选择打开，
找到d3dwindower188的文件夹，里面会有一个文件D3dHook.dll，双击它后再摁确定，
然后再选择你想欲行快捷方式后，右击选择执行（或选择上面右边第三个按钮，点击），
这样就打开你想打开的东西了，就窗口化了。（反正如果你想运行仙剑三，用这种方法就行）
好了，不废话了，你可以试试我教你的方法啦~~……
